Post-Doc en Génomique des Populations H/F Inrae
Beaucouzé - 49 CDD- Bac +5
- Service public autres
Détail du poste
- Vous serez accueilli(e) au sein de l'UMR IRHS (Institut de Recherche en Horticulture et Semences), sur le site INRAE d'Angers, dans l'équipe ResPom (Résistance du pommier et du poirier aux bioagresseurs. L'équipe ResPom s'intéresse à l'immunité du pommier et du poirier face à leur cortège de bioagresseurs. L'équipe rassemble des compétences en génétique, pathologie, biologie moléculaire et cellulaire et statistiques, et compte 18 permanents et 9 CDD et doctorants.
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L'équipe ResPom est engagée dans le projet européen FruitDiv (www.fruitdiv.eu) dont un des objectifs est la caractérisation génétique des espèces apparentées sauvages des pommiers, poiriers, abricotiers, amandiers, cerisiers, et pruniers, en vue d'établir des collections ex situ représentatives de la diversité sauvage et d'identifier des populations naturelles clé à préserver in situ. Cette caractérisation sera basée sur le re-séquençage en courts fragments qui permettra d'identifier des marqueurs de type SNP (Single Nucleotide Polymorphism). Ces données seront utilisées pour étudier la diversité génétique, sa structure et les flux de gènes entre populations et avec les espèces cultivées. Elles serviront également pour rechercher des loci associés à l'adaptation locale.
- Vous serez plus particulièrement en charge de :
- Définir le pipeline d'analyse permettant d'obtenir les données de génotypage à partir des résultats de reséquençage et le mettre en oeuvre pour les espèces apparentées au poirier
- Définir les méthodes à mettre en oeuvre dans les analyses de génétique des populations afin de définir les limites entre espèces, d'évaluer l'ampleur de la diversité génétique et la structure des populations et d'estimer les flux de gènes au sein de chaque espèce et entre les espèces sauvages et l'espèce cultivée apparentée ; réaliser ces analyses pour les espèces apparentées au poirier
- Définir les méthodes à mettre en oeuvre pour construire des core-collections qui rassemblent un maximum de diversité et en tenant compte de la structure génétique en utilisant les données de génotypage ; construire une core-collection pour les espèces apparentées au poirier
- Conditions particulières d'activité : aucune
L'adresse du poste
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Le profil recherché
- Formation recommandée : Doctorat
- Connaissances souhaitées : Connaissances en génétique des populations ; Connaissances en bio-informatique; Goût pour la programmation et le traitement de données; Maîtrise de l'anglais
- Expérience appréciée : expérience dans la manipulation de grands jeux de données
- Aptitudes recherchées : Capacité d'organisation, de planification ; autonomie; Rigueur scientifique, esprit d'analyse et de synthèse
Infos complémentaires
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Estimation basée sur les données INSEE et les offres d’emploi similaires.
Estimation basse
32 500 € / an 2 708 € / mois 17,86 € / heureSalaire brut estimé
41 200 € / an 3 433 € / mois 22,64 € / heureEstimation haute
49 200 € / an 4 100 € / mois 27,03 € / heureCette information vous semble-t-elle utile ?
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