Ingénieur·e d'Études en Biologie Structurale Computationnelle H/F INSERM
Montpellier - 34 CDD- 2 445,87 € / mois
- Bac +3, Bac +4
- Service public hospitalier
Détail du poste
La personne recrutée rejoindra une équipe multidisciplinaire dans le cadre d'un projet collaboratif innovant visant la conception computationnelle d'enzymes de modification de l'ARN. Ce projet s'inscrit dans l'axe de recherche du Dr. Cédric Leyrat, spécialiste en biologie structurale computationnelle et expérimentale. La personne recrutée aura pour principale mission de concevoir et optimiser des pipelines de calcul et jouera un rôle clé dans la réussite du projet de recherche en collaborant avec des chercheurs postdoctoraux ainsi que des partenaires externes spécialisés en bio-informatique et biologie expérimentale.
Afficher la suite
Principales activités :
- Concevoir, développer et maintenir des pipelines de calcul pour la modélisation et l'ingénierie des enzymes de modification de l'ARN ;
- Mettre en oeuvre des algorithmes de prédiction de structure protéique et de conception de protéines adaptées aux besoins du projet ;
- Exploiter des environnements UNIX afin d'assurer une exécution efficace des workflows de calcul en utilisant des serveurs HPC ;
- Optimiser les ressources de calcul et améliorer les performances des flux de travail ;
- Rédiger, optimiser et maintenir des scripts en Python et Bash pour l'automatisation des analyses et le traitement des données ;
- Développer des solutions pour automatiser la collecte et l'analyse des données expérimentales et computationnelles ;
- Se tenir au courant des nouveaux outils et algorithmes en biologie structurale computationnelle, tels que AlphaFold, Rosetta, ProteinMPNN, et RFdiffusion ;
- Intégrer ces outils dans les processus de conception et d'optimisation des enzymes ;
- Collaborer activement avec un chercheur postdoctoral, ainsi que des chercheurs et techniciens expérimentaux afin de valider les résultats des prédictions informatiques ;
- Participer à la mise en oeuvre de validations expérimentales basées sur les modèles calculés et à l'interprétation des données biologiques ;
- Rédiger et documenter les workflows de calcul, les rapports de progrès et les publications scientifiques potentielles ;
- Contribuer à la rédaction d'articles et à la présentation des résultats lors de conférences ou dans des publications scientifiques.
Le profil recherché
Connaissances :
- Connaissance des principes de la biologie structurale et de la modélisation des protéines ;
- Connaissance des outils et algorithmes modernes tels qu'AlphaFold, Rosetta, ProteinMPNN et RFdiffusion pour la prédiction de structure protéique et la conception de protéine ;
- Connaissance des processus expérimentaux de biologie structurale, ainsi que des méthodes de validation expérimentale basées sur des modèles computationnels ;
Afficher la suite
- Connaissance des pipelines de calcul pour la modélisation de protéines et d'enzymes ainsi que dans la gestion de données complexes provenant de diverses sources biologiques et expérimentales ;
- Connaissance de Python et Bash pour l'écriture et l'optimisation de scripts d'automatisation des analyses et du traitement des données ;
- Connaissance des environnements UNIX pour l'exécution efficace de workflows de calcul, en particulier l'utilisation de serveurs HPC pour l'analyse de données à grande échelle.
Savoir-faire :
- Capacité à concevoir, développer et maintenir des pipelines de calcul pour modéliser et optimiser des enzymes de modification de l'ARN ;
- Capacité à optimiser des ressources de calcul pour garantir l'efficacité des workflows en utilisant des plateformes HPC ;
- Capacité à mettre en oeuvre des algorithmes de prédiction de structure protéique pour concevoir des protéines adaptées aux objectifs du projet de recherche ;
- Capacité à intégrer et adapter ces outils pour améliorer la conception des enzymes de modification de l'ARN ;
- Capacité à travailler au sein d'une équipe multidisciplinaire en collaborant étroitement avec des chercheurs, bioinformaticiens et des biologistes expérimentaux ;
- Capacité à traduire les résultats des calculs computationnels en hypothèses biologiques testables et à participer activement à la validation expérimentale des prédictions ;
- Capacité à développer des solutions pour automatiser la collecte, l'analyse et l'intégration des données, y compris l'élaboration de scripts d'automatisation avec Python et Bash ;
- Capacité à rédiger des rapports techniques et scientifiques, y compris la documentation des workflows de calcul, les rapports de progrès et la contribution aux publications.
Savoir-être :
- Rigueur scientifique méthodique ;
- Esprit d'équipe ;
- Adaptabilité et curiosité scientifique ;
- Autonomie et proactivité.
Niveau d'expérience :
Une première expérience sur un poste similaire est fortement appréciée.
Niveau de formation :
- Niveau B2 ou C1 en anglais ;
- Niveau Bac +3 en bio-informatique, biologie computationnelle, biologie structurale ou dans un domaine connexe.
Infos complémentaires
A partir de 2445.87 € brut
- Montpellier - 34
- CDD
Créez une alerte
Pour être informé rapidement des nouvelles offres, merci de préciser les critères :
Finalisez votre candidature
sur le site du recruteur
Créez votre compte pour postuler
sur le site du recruteur !
sur le site du recruteur
sur le site du recruteur !
Recherches similaires
- Offre emploi Ingénieur
- Offre emploi Logistique
- Offre emploi Béziers
- Offre emploi Sète
- Offre emploi Agde
- Offre emploi Lunel
- Offre emploi Pézenas
- Offre emploi La Grande-Motte
- Offre emploi Frontignan
- Offre emploi Ganges
- Offre emploi Mèze
- Offre emploi Bédarieux
- Offre emploi Cariste
- Offre emploi Préparateur de commande
- Offre emploi Manutentionnaire
- Offre emploi Magasinier
- Offre emploi Approvisionneur
- Entreprises Logistique
- Entreprises Ingénieur
- Entreprises Montpellier
- Offre emploi Fonction publique
- Offre emploi Fonction publique hospitaliere
- Offre emploi Ressources
- Offre emploi Bio
- Offre emploi Developper
- Offre emploi Fonction publique Montpellier
- Offre emploi Cdd Montpellier
- Offre emploi Anglais Montpellier
- Offre emploi Niveau bac Montpellier
- Offre emploi Fonction publique hospitaliere Montpellier
- INSERM Montpellier
- INSERM Ingénieur
{{title}}
{{message}}
{{linkLabel}}