CDD Ingénieur·e d'Étude en Biologie dans une Équipe de Recherche H/F CNRS

Détail du poste

L'ingénieur d'étude participera à un projet de caractérisation de protéines virales essentielles à l'assemblage des poxvirus. Il aura pour mission de développer et entretenir l'expertise technique en virologie, biochimie, biologie cellulaire et moléculaire pour étudier le rôle de ces protéines dans le remodelage des membranes soit in vitro après reconstitution de protéoliposomes, soit directement in cellula dans un contexte d'infection virale ou non. Pour cela, il appliquera aussi différentes approches de microscopie à fluorescence, corrélative et électronique en 3D et en cryo en lien avec les plateformes technologiques de l'I2BC et les collaborateurs.
Activités
Activités Principales : Conduire un ensemble de techniques de virologie, biochimie, biologie cellulaire, biologie moléculaire, imagerie à fluorescence et microscopie électronique

Biologie cellulaire :
- Culture cellulaire (manip de transfection, d'infection et d'analyse d'interactome)

Virologie :
- Production et purification de virus L2

Biologie moléculaire :
- Clonage
- Expression de protéine en système bactérien et purification par chromatographie
- Expression de protéine membranaire in vitro en système cell-free en présence de détergent ou couplé à des microsome
- Caractérisation biochimique et biophysique des protéines recombinantes et des interactions protéines-lipides

Imagerie à fluorescence :
- Préparation d'échantillons sur cellules fixées ou live
- Acquisition et analyse de données

Microscopie électronique :
- Préparation d'échantillons pour la microscopie électronique en bloc de résine et analyse des données de volume EM
- Préparation d'échantillons par plunge-freezing pour la cryo et analyse des données de cryo microscopie électronique

Activités Transverses
- Gestion et organisation des moyens techniques pour étudier le rôle de protéines dans le remodelage des membranes soit in vitro après reconstitution de protéoliposomes, soit directement in cellula dans un contexte d'infection virale ou non
- Assurer le suivi et la veille technologique des analyses de remodellage cellulaire induit par les virus et la formation d'usines virales membranaires ou liquides en particulier
- Entretien de l'expertise méthodologique au sein du Département de Virologie en microscopie électronique 3D et cryo
Compétences
Connaissances théoriques et pratiques :
- Biologie cellulaire : expérience en culture cellulaire, transfection, analyse d'intéractome
- Biologie moléculaire : bonne connaissance des techniques de clonage, d'expression de protéines recombinantes en système bactérien et cell-free, de test d'interactions protéine-lipide et de leur caractérisation par des méthodes de biochimie et biophysique
- Virologie : connaissance des techniques d'infection de cellules de mammifères et de production et purification de particules virales souhaitée
- Imagerie : connaissance en microscopie photonique et électronique en 3D et/ou en cryo et en analyse d'image
- Réglementation en matière d'hygiène et de sécurité (P1 et P2), OGM
- Langue anglaise : B1

Compétences opérationnelles :
- Mettre en oeuvre les protocoles expérimentaux en utilisant les matériels et équipements dédiés avec une maîtrise des logiciels informatiques spécifiques
- Rédiger les protocoles et procédures techniques pour les méthodologies utilisées
- Contribuer à la communication des techniques et résultats (formations, présentations, publications)
- Encadrer et former des membres du laboratoire et des collaborateurs
- Aptitude à travailler en collaboration avec les différents partenaires des projets scientifiques de recherche et développement ou du département de Virologie ainsi que des personnels des plateformes technologiques de l'I2BC

Savoir-être :
- Aisance relationnelle
- Sens de l'organisation
- Capacité à travailler en équipe
- Rigueur / Fiabilité
- Autonomie / Confiance en soi
- Curiosité intellectuelle
Contexte de travail

L'agent sera rattaché à l'Institut de Biologie Intégrative de la Cellule (I2BC), une unité mixte de recherche CEA, CNRS et Université Paris-Saclay (UMR9198). L'unité est constituée de 59 équipes de recherches réparties dans 5 départements scientifiques, 17 plateformes technologiques et desservices supports et ssoutiens.
L'IE travaillera au sein de l'équipe "Réplication et assemblage des poxvirus" dans le département de Virologie de l'I2BC, qui apporte une nouvelle thématique de recherche, un nouveau modèle biologique (poxvirus) et une expertise technologique. Dans le cadre de l'appel pour la création de nouvelles équipes, la responsable de l'équipe a été recrutée à l'I2BC et a obtenu un financement ATIP Avenir en 2022. Il s'agira pour l'IE d'apporter un soutien technique pour un projet de caractérisation de protéines virales essentielles à l'assemblage des poxvirus en particulier. L'équipe contribue en effet au développement de la biologie cellulaire et structurale in situ à l'I2BC, une priorité stratégique du département de Virologie et de l'I2BC. L'IE accompagnera aussi l'installation du laboratoire dans les nouveaux locaux de l'I2BC et contribuera au développement de différents projets de recherche en lien avec la réplication et l'assemblage des poxvirus.
Contraintes et risques

Des déplacements sur le campus de Paris-Saclay (e.g. Synchrotron Soleil, UP-Saclay, CEA) sont à prévoir ainsi que potentiellement des visites dans le cadre de collaborations en France et à l'étranger pour des séjours de courte durée.
Pour les expériences sur le virus de la Vaccine, une formation pour travailler dans un laboratoire P2 est nécessaire.