Ingénieur de Recherche H/F Ministère de l'enseignement supérieur et de la recherche
Calais - 62 CDD- Bac +5
- Service public d'état
Détail du poste
Activités principales :
L'Unité de Chimie Environnementale et interactions sur le Vivant (UCEIV) à l'Université du Littoral Côte d'Opale (ULCO) recrute en CDD, un(e) chercheur(se) en physiologie végétale possédant des compétences solides en transcriptomique, afin de participer au projet CPER BiHauts Eco De France.
Depuis une vingtaine d'années, l'équipe Interactions Plantes/champignons et Remédiation (IPCR) de l'UCEIV s'intéresse à la sélection d'espèces végétales tolérantes aux éléments traces métalliques (ETM), possédant des capacités phytoremédatrices (phytostabilisation ou phytoextraction) et au développement de différentes filières de valorisation de la biomasse produite sur ces sols pollués, notamment par les ETM. Bien que tolérantes à de fortes teneurs en ETM, certaines espèces végétales peuvent manifester des symptômes de toxicité, en lien à leur caractère accumulateur, se traduisant par d'importants changements anatomiques et structuraux cellulaires. Par conséquent, afin de compléter l'évaluation de la performance de ces espèces végétales dans le cadre de leur utilisation dans des programmes de phytomanagement, il est indispensable d'élucider leur stratégie de prélèvement, d'accumulation et de tolérance aux ETM jusqu'à lors peu décrits chez certaines espèces. L'objectif de ce projet est d'apporter des outils pour mieux comprendre comment certaines espèces végétales réagissent à la présence des ETM dans leur environnement aux niveaux physiologique et moléculaire.
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Il s'agira par conséquent de développer des méthodes et outils reposants sur (i) le suivi et la localisation de l'expression de différents gènes impliqués dans le transport et la tolérance aux ETM, (ii) la comparaison de transcriptomes de plantes cultivées en présence ou non d'ETM afin de dresser une liste des gènes exprimés spécifiquement en réponse à la présence de ces polluants et sur (iii) des observations en microcopie confocale à balayage couplée à l'emploi de fluorophores spécifiques permettant de localiser au niveau cellulaire les ETM ainsi que les dommages qu'ils engendrent. Ce travail apportera, in fine, de données nouvelles permettant de mieux appréhender la sélection d'espèces végétales dans un contexte de réhabilitation de sites pollués au ETM.
Le profil recherché
Connaissance, savoir :
Connaissances solides en :
- Biologie et physiologie végétales
- Biologie moléculaire, transcriptomique
- Analyses bioinformatiques,
- Préparation des coupes de tissus végétaux au microtome et microscopie confocale appliquée aux cellules végétales,
- Biostatistiques.
Des connaissances dans le domaine du phytomanagement des sites et sols pollués serait un plus
Savoir faire :
· Maîtrise des techniques de biologie moléculaire (RTqPCR, extractions d'ARN, d'ADN de différentes matrices végétales et à partir du sol) et d'hybridation in situ
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· Maîtrise des techniques de microscopie confocale appliquée aux cellules végétales,
- Maîtrise de l'outil informatique et des logiciels courants de traitement et d'analyse d'images
- Biostatistiques
- Aisance rédactionnelle et à l'oral, notamment en anglais
- Veille scientifique et bibliographique
Savoir être :
- Capacités d'adaptation et d'organisation, autonomie et esprit d'équipe, esprit de synthèse et d'initiative, dynamisme
- Excellentes dispositions relationnelles et de communications
Infos complémentaires
Non renseigné
- Calais - 62
- CDD
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