Thèse Caractérisation Fonctionnelle d'Un Nouveau Facteur d'Hibernation du Ribosome chez une Archaea Hyperthermophile Marine H/F Ifremer
Plouzané - 29 CDD- 2 300 € / mois
- 🏠 Télétravail occasionnel
- 🕑 3 ans
- Bac +5
- Secteur Energie • Environnement
- Exp. - 1 an
Les missions du poste
Date de clôture de réception de candidatures : 19/05/2025
Qui sommes-nous ?
Vous serez basé.e au laboratoire de Biologie et Écologie des Écosystèmes Profonds (BEEP, Ifremer, Brest), un centre de renommée internationale en microbiologie des Archées hyperthermophiles. Le laboratoire offre des équipements de pointe pour la génétique microbienne, la protéomique et l'enzymologie, y compris des bioréacteurs à haute température et haute pression, des chambres de culture anaérobies, de la cytométrie en flux, des équipements HPLC et FPLC. Vous serez intégré.e dans un consortium de recherche interdisciplinaire et collaboratif (BIOC, École Polytechnique, Palaiseau, Emmanuelle Schmitt, experte en traduction et biologie structurale des Archées ; Groupe RNARCHAEA, Université de Toulouse, Marie Bouvier, spécialiste de la biologie des ARN des Archées et des approches omiques, EBMC, Institut Pasteur, Paris, Guillaume Borrel, expert en génomique comparative, phylogénomique) avec des opportunités de formation, de visites de recherche dans les laboratoires partenaires, de participation à des conférences et de collaborations internationales.
Quel est le sujet de la thèse ?
Caractérisation fonctionnelle d'un nouveau facteur d'hibernation du ribosome chez une archaea hyperthermophile marine.
La synthèse des protéines est l'un des processus les plus énergivores dans la cellule, et sa régulation est cruciale en conditions de stress. Chez les Archées, l'hibernation des ribosomes - une inactivation réversible des ribosomes - reste largement inexplorée. Notre laboratoire a récemment identifié un nouveau facteur d'hibernation, HIB, qui relie la régulation de la traduction au métabolisme énergétique en interagissant à la fois avec les ribosomes et les enzymes métaboliques. Des données préliminaires ont révélé qu'une souche mutante délété du gène codant pour ce facteur, chez une archaea marine (Thermococcus barophilus) présente une reprise de croissance altérée et des profils ribosomiques modifiés, suggérant un rôle central de HIB dans l'adaptation au stress. Travailler sur des Archées marines profondes associées aux sources hydrothermales est essentiel pour comprendre les mécanismes de régulation du métabolisme et de la réponse au stress dans des conditions extrêmes de température, pression et disponibilité en nutriments, offrant ainsi un modèle unique pour explorer la biologie cellulaire et les processus énergétiques fondamentaux.
Quelle sera votre mission ?
Vous contribuerez à mieux comprendre comment les archaea, des micro-organismes vivant dans des environnements extrêmes, adaptent leur métabolisme et leur machinerie de production des protéines en réponse au stress. En explorant le rôle d'un nouveau facteur de dormance des ribosomes, HIB, et son lien avec une enzyme clé du métabolisme, cette thèse vise à révéler des mécanismes fondamentaux de régulation biologique encore largement inconnus. Votre travail de doctorat s'inscrit dans une démarche interdisciplinaire à l'interface entre microbiologie, biochimie et biologie des systèmes, avec l'ambition de faire progresser nos connaissances sur la plasticité cellulaire, l'adaptation au stress, et l'évolution des stratégies de survie dans le vivant.
Quelles seront vos activités ?
Ce projet de thèse, réalisé au laboratoire BEEP d'Ifremer, se concentrera sur :
- La caractérisation phénotypique de la souche mutante hib par rapport aux souches sauvages sous conditions physiologiques et de stress (cinétiques de croissance, viabilité, tests de luciférase, Western blot).
- Une analyse transcriptomique et protéomique comparative des souches sauvages, hib, et des souches mutantes déficientes en enzymes métaboliques ciblées pour identifier les voies affectées.
- Des tests enzymatiques in vitro pour caractériser l'impact de HIB sur les principales enzymes métaboliques, en fonction de différentes charges énergétiques (ATP/ADP/AMP).
Comment se déroulera votre activité ?
- 100%. Télétravail possible
L'adresse du poste
Localisez l'entreprise et calculez votre temps de trajet en un clic !
Calculer mon temps de trajet
Le profil recherché
Qui êtes-vous ?
- Formation scientifique de niveau Master (M2 ou équivalent) en microbiologie, biologie moléculaire, biochimie ou disciplines connexes.
Vous avez les compétences, connaissances et expériences suivantes :
- Expérience pratique en microbiologie ou biologie des micro-organismes (cultures, manipulation en conditions stériles, etc.)
- Connaissances en biochimie des protéines, enzymologie ou analyse de données omiques (transcriptomique, protéomique ou métabolomique) appréciées
- Intérêt marqué pour la biologie des archées et la régulation du métabolisme cellulaire
- Aisance avec les outils informatiques de base et/ou d'analyse de données biologiques (R, Python, Excel, etc.
- Un plus, mais pas obligatoire)
- Bonnes compétences en communication scientifique, à l'oral comme à l'écrit.
- Maîtrise de l'anglais scientifique indispensable.
Vous avez les qualités suivantes :
- Capacité à travailler en équipe, curiosité, rigueur et autonomie
Bienvenue chez Ifremer
Rejoignez l'Ifremer pour un océan mieux compris, mieux protégé qui demeure un allié du bien-vivre sur la planète
Des abysses à la surface, de la côte au large, l'Ifremer est l'institut de recherche français entièrement dédié à l'Océan. Ses équipes mènent des recherches, innovent et produisent des expertises pour protéger l'océan, exploiter ses ressources de manière responsable et partager les données marines.
L'Ifremer apporte son expertise scientifique pour éclairer les politiques publiques et élabore des solutions puisées dans l'océan pour répondre aux enjeux de la transition écologique. Opérateur de la Flotte océanographique française avec sa filiale d'armement Genavir, l'Ifremer imagine, conçoit et déploie des moyens technologiques de pointe pour percer les mystères de l'océan.
Rejoignez nos équipes, composées de 1500 scientifiques et métiers supports à la recherche, et présentes sur tout le littoral métropolitain et en Outre-mer.
www.ifremer.fr
Infos complémentaires
Quels sont nos avantages ?
- Véritable opportunité de travailler sur les thématiques prioritaires de l'Ifremer, les contrats doctoraux proposés par l'Ifremer ouvrent droit, pour une durée de 3 ans, à une rémunération forfaitaire mensuelle brute égale à 2300 Euros brut, non cumulable avec d'autres bourses d'étude.
- Nous avons un accord de télétravail (à partir de 6 mois d'ancienneté) et nos collaborateurs bénéficient de 12 RTT et congés supra légaux.
- Nous consacrons un budget conséquent au développement des compétences, par des actions individuelles ou collectives.
- Nous sommes engagés dans une politique RSE inspirée des raisons d'être de l'institut (forfait mobilité durable...)
Comment postuler ?
Le dossier de candidature doit comprendre :
- Un CV
- Une lettre de motivation
- Une lettre de référence
- Un relevé de notes (Licence + Master 1 et premier semestre Master 2)
L'ensemble des documents doit être déposé sur ce site sous la forme de 2 documents.PDF. Chaque document pouvant aller jusqu'à 2 Mo.
Nous vous invitons à déposer en parallèle votre dossier auprès de l'Ecole doctorale : EDSML
Lien pour le dépôt : https://amethis.doctorat.org/amethis-client/prd/consulter/offre/918
La date limite pour la remise des candidatures est le 19 mai 2025. Néanmoins, nous vous engageons fortement à faire part dès que possible de votre intention de postuler, en prenant contact avec le responsable de sujet : Didier Flament
Les contrats des doctorants démarreront au dernier trimestre 2025, sous réserve de la production par le doctorant des documents administratifs autorisant son recrutement par l'Ifremer (attestation de réussite au Master 2 ou diplôme d'ingénieur + visa pour les doctorants étrangers hors U.E.).
Quelles sont les prochaines étapes ?
Après sélection des dossiers et un échange en visioconférence, les candidat.e.s retenu.es seront auditionnés par le jury de l'école doctorale EDSML
Créez une alerte
Pour être informé rapidement des nouvelles offres, merci de préciser les critères :
Envoyez votre candidature
dès maintenant !
Créez votre compte et
envoyez votre candidature !
dès maintenant !
envoyez votre candidature !
Recherches similaires
- Job Facteur
- Job Service Public
- Job Brest
- Job Quimper
- Job Morlaix
- Job Concarneau
- Job Douarnenez
- Job Crozon
- Job Landerneau
- Job Pleyben
- Job Landivisiau
- Job Fouesnant
- Job Ambassadeur
- Job Ripeur
- Job Chargé de développement local
- Job Directeur régional
- Job Responsable régional
- Entreprises Service Public
- Entreprises Facteur
- Entreprises Plouzané
- Job Fonction publique
- Job Débutant
- Job Poste
- Job Teletravail
- Job Marine
- Ifremer Plouzané
- Ifremer Facteur
{{title}}
{{message}}
{{linkLabel}}