Ingénieur·e Biologiste en Traitement de Données H/F Nantes Université
Nantes - 44 CDD- 23 567 - 36 693 € / an
- Bac +5
- Service public autres
Détail du poste
Missions
L'ingénieur devra réaliser une analyse basée sur des données de single-cell. Cela inclura traiter les données à l'aide du logiciel CellRanger puis les analyser avec le package R Seurat pour identifier des signature biologique associé à une «absence de réponseau traitement », une «réponse insuffisante au traitement», ou une «rechute du patient». En parallèle, le framework MOFA+ sera utiliser pour réaliser une analyse non supervisée utilisant des données multi-omiques dont celle du single cell.
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Activités principales
- Alignement des données de single-cell à l'aide du logiciel CellRanger
- Utilisation du package R Seurat pour réaliser des contrôles qualités et des analyses d'expression différentielles entre plusieurs groupes pour identifier des signatures biologiques spécifique à chaque groupe de participants.
- Utilisation du framework MOFA+ pour réaliser une analyse non supervisée à l'aide des données de single-cell.
Le profil recherché
- Formation et/ou qualification : Formation en immunologie et bio-informatique
- Expériences antérieures bienvenues pour occuper le poste : analyse de données transcriptomiques avec le langage de programmation R.
- Savoir utiliser les langages de programmation R et bash
- Poste ouvert aux agents susceptibles de se prévaloir d'une priorité légale conformément aux dispositions de l'article L.512-19 du Code Général de la Fonction Publique (sur présentation d'un justificatif).
Infos complémentaires
Entre 23 567 et 36 693€
- Nantes - 44
- CDD
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